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Ehrenberg，1795-1876）在1828年提出，用來指代某種細菌。這個詞來源於希臘語βακτηριον，意為「小棍子」。1866年，德國動物學家海克爾（Ernst Haeckel，1834-1919）建議使用「原生生物」，包括所有單細胞生物（細菌、藻類、真菌和原生動物）。1878年，法國外科醫生塞迪悅（Charles Emmanuel
Sedillot，1804-1883）提出「微生物」來描述細菌細胞或者更普遍的用來指微小生物體。因為細菌是單細胞微生物，用肉眼無法看見，需要用顯微鏡來觀察。1683年，列文虎克（Antony van Leeuwenhoek，1632–1723）最先使用自己設計的單透鏡顯微鏡觀察到了細菌，大概放大200倍。路易·巴斯德（Louis Pasteur，1822-1895）和羅伯特·科赫（Robert Koch，1843-1910）指出細菌可導致疾病。細菌可以以無性或者遺傳重組兩種方式繁殖，最主要的方式是以二分裂法這種無性繁殖的方式：一個細菌細胞細胞壁橫向分裂，形成兩個子代細胞。並且單個細胞也會通過如下幾種方式發生遺傳變異：突變（細胞自身的遺傳密碼發生隨機改變），轉化（無修飾的DNA從一個細菌轉移到溶液中另一個細菌中），轉染（病毒的或細菌的DNA，或者兩者的DNA，通過噬菌體轉移到另一個細菌中），細菌接合（一個細菌的DNA通過兩細菌間形成的特殊的蛋白質結構，接合菌毛，轉移到另一個細菌）。細菌可以通過這些方式獲得DNA，然後進行分裂，將重組的基因組傳給後代。許多細菌都含有包含染色體外DNA的質體。處於有利環境中時，細菌可以形成肉眼可見的集合體，例如菌簇。細菌以芽孢的形式度過有限的不利環境，如巴氏（低溫）消毒（70 -80攝氏度）的食品不能久存。細菌具有許多不同的代謝方式。一些細菌只需要二氧化碳作為它們的碳源，被稱作自養生物。那些通過光合作用從光中獲取能量的，稱為光合自養生物。那些依靠氧化化合物中獲取能量的，稱為化能自養生物。另外一些細菌依靠有機物形式的碳作為碳源，稱為異養生物。光合自養菌包括藍細菌（藍藻，Cyanobacteria），它是已知的最古老的生物，可能在製造地球大氣的氧氣中起了重要作用。其他的光合細菌進行一些不製造氧氣的過程。包括綠硫細菌，綠非硫細菌，紫硫細菌，紫非硫細菌和太陽桿菌。正常
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